Король Карл X Густав перенял руководство польской регулярной армией и вступил в Варшаву. Казаки и московичи разоряли остальную часть Литвы и Польши. Король Ян Казимир со своим сундуком золота и драгоценностей сбежал в Силезию.

После того, как шведы заняли Польшу, литовским войскам надо было решать, сдаться шведам или быть побежденными московичами и казаками, которые напирали с востока и юго-востока.

Главнокомандующий литовскими военными силами князь Януш Радзивилл был ярый кальвинист. В школах Западной Европы он получил отличное образование и много путешествовал. Он долго воевал с московичами и казаками, смотрел на них с презрением, поэтому он решил передать шведам руководство своими силами . Казалось, что в тот момент они подавали больше благих надежд. Януш Радзивилл мечтал создать со Швецией конфедерацию, в которой она наравне с Литвой, как равноправный партнер заменила бы Польшу, и таким образом Литву стали бы защищать военные и морские силы Швеции. С этой целью 18 августа 1655 года Радзивилл подписал пакт со шведским генералом Делагарди, но у короля Карла X Густава намерения были совсем другие. По его идее было бы правильней Республику обоих народов вообще устранить из членов федерации.

Польский историк Людвик Кубала (Ludwik Kubala) в своей книге «Война со шведами» подробно описывает шведского короля: «Король Карл X Густав был черств душой, жестокий, безнравственный и упрямый, человек с непоколебимо железной волей и силен как смерть, видный руководитель, политик с неиссякающим воображением. С другой стороны, он был человеком разрушителем и орудием своей же, все уничтожающей натуры, зарождающей, оживляющей и разрушающей, не знающей пощады, не признающей справедливости, верности, надежды, любви и других прав человека, а также взаимных обязательств».

«Он нарушал все обещания, сделки и акты о капитуляции, которые подписывал сам и гарантировал их соблюдение своим королевским словом. Он безжалостно разорял города и поселения, взятые коварством, обещаниями и ложью. Он позволял своим солдатам свободно грабить имения дворян, чью безопасность он гарантировал своими же письмами. Он был настоящим артистом, с юмором и цинизмом брал контрибуции, захватывал и грабил. Огнем и мечом он разорял Польшу: он вешал священников и вельмож, колесами ломал их кости, стрелял и жарил их на огне, без суда и следствия пытал их. Его воззвание от 8 марта 1656 года к крестьянам и горожанам убивать господ и мелких дворян, обещая вознаграждение за каждую голову упрямого господина, возбудило во всей Европе невероятное удивление. Карл Густав требовал денег для себя и добычи для своих солдат. Война для него была средством для содержания армии и только война могла его подкреплять».

Он любил говорить, что «умело используя железо, которым для нас природа не поскупилась, мы можем обеспечить себя золотом».

Подразделения Карла X Густава в Литве вели себя не как союзники, а как вражеские оккупационные войска. Его солдаты грабили и все разоряли точно так же, как московичи или татары. Во время приступов черствости, он словно хотел превозмочь Ивана Грозного в его страсти к жестокости.

Литовцы во всем обвиняли князя Радзивилла. Мелкие дворяне жаждали уничтожить его за помощь шведам. Много знатных литовцев стало бороться между собой, обвинять друг друга, а не воевать со шведами. Князь Павел Сапега (Povilas Sapiega) собрал войско для уничтожения Радзивилла, но тот бежал, а 31 декабря 1656 года был найден мертвым. Сторонников Радзивилла преследовали их прежние враги, поэтому пострадали тысячи кальвинистов. Многие их них решили эмигрировать в Голландию, откуда в 1659 году, при сопровождении Питера Стейвесанта (Pieter Stuyvesant), отплыли в Америку и обосновались в Новом Амстердаме, то есть в будущем Нью-Йорке.

Как и в былые времена, шведы в Самогитии тоже потерпели свое «Ватерлоо», так как, унаследовавшая титулы знать (в противоположность Литве это в большинстве своем были небогатые крестьяне), создала небольшие партизанские отряды и приносила шведским силам большой ущерб. Во многих местах целые шведские подразделения бесследно пропали, словно испарились в воздухе. Шведские солдаты и днем, и ночью боялись отдельно ступать на землю Самогитии. В целях безопасности они часто отходили в Ливонию или Литву, избегая выполнять порученные задания в Самогитии.

Успех партизанской войны самогитов вдохновил и литовцев использовать такую же тактику в своей стране, и вскоре шведы были вытеснены из Литвы.

Карл X Густав скончался в 1660 году. Война со шведами закончилась, но продолжалась с государством Московским.

Царь Алексей Михайлович делал попытки занять престол короля Польши, так как во время шведской оккупации влиятельные члены польского сейма способствовали воплощению его надежд, но образовавшаяся сильная оппозиция в Польше и Литве воспротивилась утверждению влияния московичей.

Царь и дальше с большим или меньшим успехом продолжал военные действия против Литвы и Польши, но вскоре военная удача от московичей отвернулась, так как в марте 1659 года недовольные казаки восстали. Они отказались присягать на верность Московскому царю и Польше и окончательно покорились турецкому султану.

Когда остался лишь один враг, Литва освободилась от московичей, и кончились все жестокости, которые пришлось терпеть целых шесть лет на оккупированных царем землях.

Государство Московское стремилось к перемирию и добилось его. Между Республикой Литвой, Польшей и Москвой оно было подписано 30 января 1667 года, но окончательный мирный договор был подписан только в июне 1686 года.

Наконец, в 1668 году неспособный и неосмотрительный король Ян Казимир отказался от трона. Со слезами на глазах он пророчил для страны мрачное будущее, но он уже потерял уважение людей и не смог уменьшить постоянно существующих разногласий между Литвой и Польшей.

После Яна Казимира Королем Польши и великим князем литовским стала малоизвестная личность – князь Михаил Корибут Вишневецкий (Michal Korybut Wisniowecki), отец которого прославился, защищая население от казаков. Он был литовцем, потомком великого князя литовского Гедимина. Вишневецкий правил только четыре года - в ноябре 1673 он скоропостижно скончался.